Scopul unei consultații de neuropsihiatrie este de a evalua pacienții și de a diagnostica starea acestora. În urma unor teste suplimentare, neuropsihiatrii pot recomanda fie un plan de tratament pe termen scurt, fie pe termen lung, în funcție de cazul fiecărui pacient.

Fiecare consultație poate decurge diferit, în funcție de condiția pacientului, însă în linii mari, aceasta constă în următorii pași: 

• Majoritatea consultațiilor de neuropsihiatrie încep cu o trimitere. Pacientul este îndrumat de către neurologul sau neurochirurgul său către un neuropsihiatru, care va primi de la unul din ce doi informațiile pacientului și istoricul său medical.
• De obicei, pacientul trebuie să completeze un chestionar de sănătate (cu pastrarea confidențialității) care detaliază istoricul său medical anterior și actual și o listă de verificare a simptomelor și scalele de evaluare. În anumite cazuri, membrii familiei sau îngrijitorii sunt, de asemenea, invitați să își prezinte propriile opinii.
• Ulterior, medicul va obține semnele vitale ale pacientului și va efectua un examen fizic amănunțit. De asemenea, un examen neurologic cuprinzător, un interviu psihiatric și un test care va determina starea psihică a pacientului vor fi efectuate de către neuropsihiatru.
• Va începe apoi o serie exhaustivă de teste psihologice și neurocognitive. Testele vor evalua sentimentele pacientului, personalitatea lui și tiparele de gândire. Acestea vor măsura și alte aspecte, precum durata atenției, funcția memoriei, gândirea logică sau timpul de reacție.
   

În cazul în care rezultatele inițiale sunt neconcludente, pot fi efectuate teste suplimentare.

Odată ce medicul a stabilit diagnosticul, va recomanda pacientului un program de tratament, acesta din urmă prezentandu-se periodic pentru alte consultații cu scopul de a se monitoriza evoluția. În unele cazuri, pacienții sunt îndrumați către un specialist diferit, în funcție de natura afecțiunii